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植物學上藏紅花和紅花（草紅花）不是一個科屬，藏紅花屬鳶尾科番紅花屬，是多年生草本植物，一般只開花不結種子，靠球莖繁殖，原產于西班牙等地中海沿岸國家，歷史上我國一直從西方國家進口，故叫西紅花。西紅花是從印度經西藏傳入內地的，故又叫藏紅花。藏紅花因產地而得名完全是一種誤解，其實西藏并不出產藏紅花，其正規的藥材名稱應該是西紅花。
藏紅花的藥用部位為其紅色雌蕊，有油潤光澤，細長線型，長約3厘米，氣特異，味微苦。將藏紅花花絲浸入水中，浸出的橙黃色逐漸擴散，在短時間內整杯水即被染成黃色，無沉淀。
紅花又稱草紅花、刺紅花等，屬菊科，是雙子葉植物門的一年生草本植物，靠種子繁殖。藥用部位為其干燥的管狀花冠，整花入藥，長約1.5厘米，橙紅色，有香氣，味微苦。
二、從價格上的區別
藏紅花和紅花（草紅花）兩者在價格上相差幾百甚至上千倍。藏紅花是名貴婦科良藥，被西班牙人譽為“紅色金子”，歷史上我國一直依靠進口，僅供宮廷和官宦人家使用，價格昂貴。我國于1965年開始引種藏紅花，現已在北京、浙江、上海、河南等22個省市引種成功，但由于需求量增大，市場缺口仍然很大，藥材市場成交價一直穩定在每公斤10000-15000元，藥店零售價為每公斤5-10萬元左右。紅花為普通中藥材，種植面積大，產量比藏紅花高得多，市場價每公斤只有20元左右。
三、從功效上的區別
藏紅花和紅花（草紅花）在藥效上也不是一個檔次的。據《藥典》記載，藏紅花有活血化淤、涼血解毒、解郁安神的功效，用于治療經閉、產后淤阻、憂郁痞悶、驚悸發狂等，對肝癌、脾癌、腎癌、胃癌、子宮癌等也有一定療效。
紅花（草紅花）的功能在某些方面和藏紅花有相似之處，如活血通經、養血祛斑、消腫止痛等，但在同等劑量的條件下藏紅花的藥效是紅花的好多倍。不過在藏紅花難以買到或無經濟能力購買的情況下，可以適當地用紅花代替。
另外，藏紅花還被大量用于食品、香料、染料等工業，近代各國還用做食品作料，被譽為“作料皇后”、“廚房瑰寶”。現在藏紅花還被用于化妝美容、養顏護膚等。
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